类风湿关节炎是一种病因复杂的自身免疫疾病，其特征是关节破坏，全身器官受累，以及自身抗体滴度升高，例如抗瓜氨酸肽抗体（ACPA）。肠道菌群在维持机体免疫稳态方面起着至关重要的作用，虽然目前已有研究表明肠道微生物与类风湿发病相关，但其机制尚未完全清晰。个体肠道微生物的组成高度多样性，极大影响疾病相关的微生物特征识别。


　　近日，北京大学人民医院风湿免疫科栗占国团队和中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）康禹副研究员团队合作，在 Science 子刊 Science Advances 发表了题为：Intestinal butyrate-metabolizing species contribute to autoantibody production and bone erosion in rheumatoid arthritis的研究论文。

　　该研究发现类风湿患者肠道中丁酸代谢菌群通过影响肠道内丁酸净含量，参与类风湿关节炎疾病活动、抗体生产和关节变形，揭示了肠道内丁酸代谢菌在类风湿关节炎发病机制中的关键作用，以及丁酸调节类风湿关节炎患者免疫反应的分子机制，提示了丁酸对类风湿关节炎临床治疗潜力。

　　该研究中，针对人类肠道菌群的高度多样性和宿主异质性造成的特征菌群检出效力不足问题，研究人员采用了一种新的宏基因组分析策略——“类配对”算法。该策略原理上类似于双生子研究识别疾病相关遗传变异。在高维度的宏基因组数据中，组成成分高度相似但分属不同组别（case-control）的样本视为“双生子”，即配对样本，基于新组成的配对样本队列进行宏基因组数据分析，可以更好地控制个体间的高度多样性，增加统计效力，提高识别疾病关联微生物组特征的敏感性和稳定性。

　　该研究中，利用“类配对”算法不但发现多种产丁酸菌和耗丁酸菌在类风湿患者与健康人群的肠道组成中呈现相反的分布趋势，而且这些丁酸代谢相关物种丰度与ACPA抗体、类风湿因子等临床指标呈现强关联性。基于这些丁酸代谢菌种的丰度建立的诊断模型，不但可以准确区分患者和健康人群，而且预测患者发生关节变形的准确率高达98.6%。

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